วิธีการโคลนนิ่งโดยตรง จับภาพผลิตภัณฑ์ธรรมชาติของจุลินทรีย์ที่แปลกใหม่

จุลินทรีย์มีกลุ่มยีนสังเคราะห์ทางชีวภาพของผลิตภัณฑ์จากธรรมชาติ (BGCs) ซึ่งอาจเก็บกักฤทธิ์ทางชีวภาพที่มีลักษณะเฉพาะสำหรับใช้ในการพัฒนายาและการใช้งานด้านการเกษตร อย่างไรก็ตาม BGCs ของจุลินทรีย์ที่ไม่มีลักษณะเฉพาะจำนวนมากยังคงไม่สามารถเข้าถึงได้ ก่อนหน้านี้ นักวิจัยจาก University of Illinois Urbana-Champaign ได้สาธิตเทคนิคที่ใช้ตัวล่อปัจจัยการถอดความเพื่อกระตุ้น BGCs ขนาดใหญ่ที่เงียบในแบคทีเรียเพื่อช่วยในการค้นพบผลิตภัณฑ์จากธรรมชาติตอนนี้พวกเขาได้พัฒนาวิธีการโคลนโดยตรงซึ่งมีจุดมุ่งหมายเพื่อเร่งการค้นพบผลิตภัณฑ์ธรรมชาติที่แปลกใหม่ในปริมาณมาก โคลนนิ่ง การค้น พบของพวกเขาได้รับการรายงานในวารสารNature Communications ชื่อ Cas12a ช่วยการโคลนเป้าหมายที่แม่นยำโดยใช้ in vivo Cre-lox recombination (CAPTURE) วิธีการนี้ช่วยให้สามารถโคลนชิ้นส่วนจีโนมขนาดใหญ่ได้โดยตรง รวมถึงชิ้นส่วนที่มีเนื้อหา GC สูงหรือลำดับซ้ำ ในกรณีที่วิธีการโคลนโดยตรงที่มีอยู่ล้มเหลวในการโคลนผลิตภัณฑ์ธรรมชาติ BGCs ในลักษณะนี้ได้อย่างมีประสิทธิภาพ CAPTURE นั้นยอดเยี่ยม "การใช้ CAPTURE ทำให้ BGCs ของผลิตภัณฑ์จากธรรมชาติของจุลินทรีย์สามารถโคลนได้โดยตรงและแสดงออกต่างกันในอัตราที่ไม่เคยมีมาก่อน" Huimin Zhao ผู้นำการศึกษาและประธานสตีเวน แอล. มิลเลอร์ ประธานสาขาวิศวกรรมเคมีและชีวโมเลกุล กล่าว และยังเป็นสมาชิกของสถาบัน Carl R. Woese Institute for ชีววิทยาจีโนมที่รัฐอิลลินอยส์ "ผลที่ตามมาคือ CAPTURE ช่วยให้สามารถโคลน BGCs ของผลิตภัณฑ์ธรรมชาติจากสิ่งมีชีวิตต่างๆ ในปริมาณมาก ซึ่งอาจนำไปสู่การค้นพบผลิตภัณฑ์ธรรมชาติใหม่ๆ มากมาย"